Browser By Pseudochromosome

Instruction:
     Through a large consensus genetic map, genomic WGS scaffolds was ordered, oriented on chromosomal pseudomolecule. Nine chromosome size pseudomolecules was created, and scaffold was oriented and integrated by 100 N bps. Picture below is cartoon of nine pseudochromosomes. Users can look though genes of every pseudochromosome by click.

Now, Gene lists of C01 is displayed below (Default:C01 and 300 genes in one page):

GeneStartEndLengthStrandChromsome
 Bol039720 13401895 13402374 480 - C01
 Bol039721 13403409 13403582 174 - C01
 Bol039709 13294014 13295841 1828 - C01
 Bol039710 13296680 13297392 713 - C01
 Bol039711 13300175 13300717 543 + C01
 Bol039719 13374897 13376300 1404 + C01
 Bol039716 13360703 13361946 1244 + C01
 Bol039717 13368304 13371234 2931 + C01
 Bol039718 13371680 13372246 567 - C01
 Bol039715 13351287 13354857 3571 - C01
 Bol039714 13344461 13345012 552 + C01
 Bol039712 13313366 13313908 543 + C01
 Bol039713 13326266 13326817 552 + C01
 Bol039708 13289813 13292638 2826 - C01
 Bol039698 13218871 13221473 2603 - C01
 Bol039699 13222077 13231380 9304 + C01
 Bol039700 13231731 13234130 2400 - C01
 Bol039701 13252187 13253751 1565 - C01
 Bol039702 13259934 13260590 657 + C01
 Bol039703 13262955 13263611 657 + C01
 Bol039704 13267686 13268156 471 - C01
 Bol039705 13272362 13275831 3470 - C01
 Bol039696 13212846 13215024 2179 + C01
 Bol039697 13215385 13218170 2786 - C01
 Bol039706 13277142 13281820 4679 - C01
 Bol039707 13286330 13288995 2666 + C01
 Bol039693 13188818 13189036 219 - C01
 Bol039694 13204358 13207959 3602 + C01
 Bol039695 13209115 13212433 3319 - C01
 Bol039692 13182019 13182468 450 - C01
 Bol039691 13178488 13180053 1566 - C01
 Bol039681 13044096 13045601 1506 - C01
 Bol039682 13067270 13067503 234 + C01
 Bol039683 13084538 13085291 754 + C01
 Bol039684 13102353 13102803 451 - C01
 Bol039685 13126743 13133636 6894 - C01
 Bol039686 13161093 13162550 1458 + C01
 Bol039687 13163533 13165038 1506 + C01
 Bol039688 13165920 13166321 402 - C01
 Bol039689 13168419 13169381 963 + C01
 Bol039690 13173579 13175475 1897 - C01
 Bol039677 13009474 13011438 1965 + C01
 Bol039678 13011734 13012474 741 - C01
 Bol039679 13026545 13028578 2034 - C01
 Bol039680 13035762 13041734 5973 - C01
 Bol039665 12947089 12947274 186 - C01
 Bol039666 12948086 12950193 2108 + C01
 Bol039667 12956830 12960039 3210 + C01
 Bol039668 12969990 12970370 381 + C01
 Bol039664 12945726 12946841 1116 + C01
 Bol039676 13006075 13009208 3134 - C01
 Bol039670 12987527 12991209 3683 + C01
 Bol039671 12992924 12996112 3189 + C01
 Bol039672 12996767 12998368 1602 + C01
 Bol039673 12999073 12999706 634 - C01
 Bol039674 13001061 13002480 1420 - C01
 Bol039675 13003013 13005615 2603 - C01
 Bol039669 12970935 12973832 2898 - C01
 Bol039663 12943199 12944680 1482 + C01
 Bol039662 12928187 12930993 2807 - C01
 Bol039656 12884702 12888245 3544 + C01
 Bol039657 12891636 12893025 1390 + C01
 Bol039658 12893274 12894637 1364 - C01
 Bol039659 12897086 12898702 1617 + C01
 Bol039660 12899012 12901114 2103 - C01
 Bol039661 12904339 12907115 2777 - C01
 Bol039648 12826398 12832444 6047 - C01
 Bol039649 12833165 12834563 1399 - C01
 Bol039650 12841520 12841919 400 + C01
 Bol039651 12849124 12851730 2607 + C01
 Bol039652 12859832 12860281 450 - C01
 Bol039653 12862356 12863533 1178 + C01
 Bol039654 12868893 12869921 1029 - C01
 Bol039655 12871920 12875186 3267 - C01
 Bol039647 12823397 12824995 1599 - C01
 Bol039636 12729839 12731434 1596 + C01
 Bol039637 12739208 12740639 1432 + C01
 Bol039638 12746155 12748914 2760 - C01
 Bol039645 12783125 12784431 1307 + C01
 Bol039646 12786718 12789565 2848 - C01
 Bol039643 12777035 12778087 1053 - C01
 Bol039644 12779120 12782418 3299 + C01
 Bol039642 12775030 12775830 801 + C01
 Bol039639 12750873 12751046 174 - C01
 Bol039640 12760011 12760319 309 - C01
 Bol039641 12770288 12772127 1840 + C01
 Bol039634 12712543 12714201 1659 + C01
 Bol039635 12726660 12728891 2232 + C01
 Bol039633 12692688 12694047 1360 + C01
 Bol039632 12686615 12691824 5210 - C01
 Bol039626 12619270 12620082 813 + C01
 Bol039625 12600970 12601308 339 - C01
 Bol039624 12598907 12600673 1767 + C01
 Bol039631 12684273 12686380 2108 + C01
 Bol039630 12681483 12682651 1169 + C01
 Bol039628 12648329 12649915 1587 - C01
 Bol039629 12667675 12668824 1150 - C01
 Bol039627 12644718 12645008 291 - C01
 Bol039623 12597042 12598121 1080 - C01
 Bol039620 12590177 12590494 318 - C01
 Bol039621 12592344 12593174 831 + C01
 Bol039619 12587449 12587628 180 - C01
 Bol039618 12574525 12582231 7707 - C01
 Bol039622 12594755 12596492 1738 - C01
 Bol039617 12573614 12574335 722 + C01
 Bol039615 12537626 12538484 859 - C01
 Bol039616 12549168 12551945 2778 - C01
 Bol039613 12529933 12530907 975 - C01
 Bol039614 12535786 12536828 1043 - C01
 Bol039607 12466707 12467762 1056 + C01
 Bol039608 12468084 12469488 1405 - C01
 Bol039609 12489108 12490246 1139 - C01
 Bol039610 12498940 12500546 1607 + C01
 Bol039611 12523124 12523486 363 + C01
 Bol039612 12528663 12529240 578 - C01
 Bol039593 12337735 12339286 1552 - C01
 Bol039606 12456443 12457520 1078 + C01
 Bol039605 12453747 12455523 1777 + C01
 Bol039604 12438007 12442211 4205 - C01
 Bol039603 12434511 12435374 864 - C01
 Bol039601 12426224 12428396 2173 + C01
 Bol039602 12430356 12432781 2426 + C01
 Bol039600 12377371 12377538 168 - C01
 Bol039595 12354993 12355766 774 - C01
 Bol039596 12356992 12359616 2625 - C01
 Bol039597 12360276 12363084 2809 + C01
 Bol039598 12366305 12366881 577 - C01
 Bol039599 12372942 12374477 1536 - C01
 Bol039594 12351788 12354511 2724 + C01
 Bol039592 12325139 12328866 3728 + C01
 Bol039590 12293241 12293625 385 + C01
 Bol039591 12299456 12301075 1620 + C01
 Bol039589 12232952 12234331 1380 + C01
 Bol039588 12222766 12231082 8317 + C01
 Bol039587 12131607 12138706 7100 + C01
 Bol039582 12079801 12081453 1653 - C01
 Bol039583 12082672 12083070 399 + C01
 Bol039584 12101966 12102136 171 - C01
 Bol039585 12105851 12107101 1251 - C01
 Bol039586 12114930 12116327 1398 + C01
 Bol039580 12072219 12077029 4811 + C01
 Bol039581 12077393 12079229 1837 + C01
 Bol039576 12034690 12035187 498 - C01
 Bol039577 12038288 12040148 1861 + C01
 Bol039578 12058493 12059655 1163 + C01
 Bol039579 12060698 12066958 6261 + C01
 Bol039572 11981492 11983340 1849 + C01
 Bol039573 11984256 11986349 2094 + C01
 Bol039574 12012633 12013597 965 + C01
 Bol039575 12013993 12016899 2907 - C01
 Bol039571 11961954 11969191 7238 - C01
 Bol039566 11931053 11931403 351 + C01
 Bol039567 11938195 11941554 3360 + C01
 Bol039568 11942929 11946819 3891 + C01
 Bol039562 11882494 11884843 2350 + C01
 Bol039569 11947061 11949007 1947 - C01
 Bol039570 11958063 11961114 3052 + C01
 Bol039565 11905073 11906186 1114 - C01
 Bol039564 11898829 11899877 1049 + C01
 Bol039563 11886363 11887597 1235 + C01
 Bol039561 11879084 11880306 1223 - C01
 Bol039560 11867291 11869297 2007 - C01
 Bol039559 11854750 11855067 318 + C01
 Bol039557 11835257 11836402 1146 - C01
 Bol039558 11838886 11840607 1722 - C01
 Bol039556 11831205 11833805 2601 - C01
 Bol039554 11823129 11823296 168 - C01
 Bol039555 11828339 11830240 1902 - C01
 Bol039553 11822464 11823045 582 - C01
 Bol039547 11807259 11809880 2622 - C01
 Bol039548 11813900 11816166 2267 - C01
 Bol039552 11820733 11822125 1393 + C01
 Bol039549 11816915 11818101 1187 + C01
 Bol039550 11818517 11819083 567 - C01
 Bol039551 11819169 11819330 162 - C01
 Bol039546 11803966 11806081 2116 + C01
 Bol039544 11793978 11796886 2909 + C01
 Bol039545 11797466 11798961 1496 - C01
 Bol039543 11788027 11789832 1806 - C01
 Bol039542 11774672 11777783 3112 + C01
 Bol039538 11750379 11754211 3833 + C01
 Bol039539 11755684 11756654 971 + C01
 Bol039540 11759331 11759868 538 - C01
 Bol039541 11772894 11774156 1263 - C01
 Bol039536 11733970 11735976 2007 - C01
 Bol039537 11744261 11746964 2704 + C01
 Bol039534 11720214 11723395 3182 + C01
 Bol039535 11731233 11731406 174 - C01
 Bol039532 11701704 11703973 2270 - C01
 Bol039533 11717281 11719282 2002 + C01
 Bol039530 11692173 11692772 600 + C01
 Bol039531 11698699 11700865 2167 - C01
 Bol039529 11687638 11687979 342 - C01
 Bol039527 11622628 11624071 1444 - C01
 Bol039528 11663982 11664972 991 - C01
 Bol039525 11603543 11603864 322 + C01
 Bol039526 11615776 11617537 1762 - C01
 Bol039524 11578187 11579058 872 + C01
 Bol039521 11529063 11531198 2136 + C01
 Bol039522 11531560 11532470 911 + C01
 Bol039523 11552926 11554464 1539 - C01
 Bol039519 11507330 11508950 1621 + C01
 Bol039520 11510463 11513128 2666 - C01
 Bol039517 11500544 11501691 1148 + C01
 Bol039518 11502360 11503555 1196 - C01
 Bol039516 11497050 11497938 889 + C01
 Bol039515 11481927 11485273 3347 - C01
 Bol039513 11476809 11477396 588 + C01
 Bol039514 11480661 11481266 606 - C01
 Bol039512 11466479 11467078 600 + C01
 Bol039506 11441945 11443036 1092 + C01
 Bol039507 11444971 11446979 2009 + C01
 Bol039508 11447263 11447433 171 - C01
 Bol039509 11448527 11450788 2262 + C01
 Bol039510 11454033 11457221 3189 + C01
 Bol039511 11461696 11464276 2581 + C01
 Bol039494 11357580 11361074 3495 - C01
 Bol039495 11361744 11362722 979 - C01
 Bol039496 11363274 11364167 894 + C01
 Bol039497 11364796 11365940 1145 - C01
 Bol039490 11331578 11333221 1644 - C01
 Bol039505 11430834 11431560 727 + C01
 Bol039504 11413114 11414782 1669 - C01
 Bol039503 11410432 11412534 2103 - C01
 Bol039502 11406754 11407845 1092 - C01
 Bol039501 11398299 11400368 2070 + C01
 Bol039500 11384114 11384287 174 + C01
 Bol039499 11368626 11368889 264 - C01
 Bol039498 11366737 11368105 1369 - C01
 Bol039493 11354913 11356423 1511 - C01
 Bol039491 11333710 11335032 1323 - C01
 Bol039492 11351245 11351791 547 - C01
 Bol039488 11326117 11329714 3598 + C01
 Bol039489 11330139 11331167 1029 + C01
 Bol039487 11324554 11325273 720 + C01
 Bol039485 11269592 11270017 426 + C01
 Bol039486 11322636 11323718 1083 + C01
 Bol039484 11261871 11262131 261 + C01
 Bol039483 11252208 11252556 349 - C01
 Bol039477 11209241 11210508 1268 + C01
 Bol039478 11217080 11221038 3959 + C01
 Bol039479 11226626 11226883 258 + C01
 Bol039480 11231019 11232028 1010 - C01
 Bol039481 11240122 11241757 1636 - C01
 Bol039474 11201553 11202506 954 - C01
 Bol039475 11203792 11206113 2322 + C01
 Bol039482 11251378 11255067 3690 + C01
 Bol039476 11206422 11208909 2488 + C01
 Bol039473 11200195 11200630 436 - C01
 Bol039472 11198076 11199011 936 - C01
 Bol039471 11195871 11197613 1743 + C01
 Bol039469 11169459 11176299 6841 - C01
 Bol039470 11190957 11193752 2796 - C01
 Bol039467 11165597 11166325 729 + C01
 Bol039468 11166810 11169039 2230 - C01
 Bol039466 11164580 11165284 705 + C01
 Bol039465 11162971 11164436 1466 + C01
 Bol039464 11158842 11161718 2877 + C01
 Bol039463 11146435 11146935 501 + C01
 Bol039461 11128047 11129553 1507 - C01
 Bol039462 11143576 11144226 651 + C01
 Bol039459 11108185 11110701 2517 - C01
 Bol039458 11102890 11107619 4730 - C01
 Bol039460 11113144 11115145 2002 - C01
 Bol039456 11096289 11099307 3019 - C01
 Bol039457 11100184 11101228 1045 - C01
 Bol039455 11095531 11095947 417 - C01
 Bol039452 11075210 11078103 2894 - C01
 Bol039453 11083021 11088532 5512 + C01
 Bol039449 11057886 11060054 2169 + C01
 Bol039450 11066243 11067169 927 + C01
 Bol039451 11070710 11071384 675 - C01
 Bol039454 11092492 11095062 2571 + C01
 Bol036614 22429238 22433011 3774 - C01
 Bol036613 22428267 22428794 528 + C01
 Bol036612 22405156 22407592 2437 - C01
 Bol036608 22358239 22358439 201 - C01
 Bol036609 22359512 22360455 944 - C01
 Bol036610 22361261 22361773 513 - C01
 Bol036611 22401876 22402816 941 - C01
 Bol036601 22231126 22232079 954 + C01
 Bol036602 22236130 22238818 2689 + C01
 Bol036603 22242706 22242975 270 + C01
 Bol036604 22248319 22249905 1587 + C01
 Bol036605 22262706 22264730 2025 + C01
 Bol036606 22350182 22350860 679 - C01
 Bol036607 22352416 22354432 2017 + C01
 Bol036598 22151356 22151541 186 - C01
 Bol036599 22162621 22163190 570 - C01
 Bol036600 22180736 22181497 762 - C01
 Bol036595 22052177 22059297 7121 + C01
 Bol036596 22063057 22064458 1402 + C01
 Bol036593 22042243 22043273 1031 - C01
 Bol036594 22044475 22045455 981 - C01
 Bol036591 22029097 22031136 2040 + C01
 Bol036597 22074220 22076272 2053 + C01
 Bol036590 22012621 22014820 2200 + C01
 Bol036592 22032200 22036310 4111 - C01
 Bol036589 21986902 21987982 1081 - C01
 Bol036587 21916251 21917031 781 + C01
Total genes: 3591
Total pages:12 / 
@2012 Department of Genomics and Molecular Biology, Oil Crops Research Institute.


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